বিজ্ঞানীরা 230 দৈত্য সমুদ্রের ভাইরাসগুলি উন্মোচন করেন যা সালোকসংশ্লেষণ হাইজ্যাক করে


দৈত্য ভাইরাসগুলি প্রোটিস্ট নামে পরিচিত একক কোষযুক্ত সামুদ্রিক জীবের বেঁচে থাকার ক্ষেত্রে ভূমিকা রাখে। এর মধ্যে রয়েছে শেত্তলা, অ্যামিবা এবং ফ্ল্যাজেললেটগুলি যা সমুদ্রের খাদ্য জালগুলির ভিত্তি তৈরি করে। এবং যেহেতু এই প্রতিবাদকারীরা খাদ্য শৃঙ্খলার একটি গুরুত্বপূর্ণ অঙ্গ গঠন করে, তাই এই বৃহত ডিএনএ ভাইরাসগুলি প্রায়শই ক্ষতিকারক অ্যালগাল ফুল সহ বিভিন্ন জনস্বাস্থ্যের ঝুঁকির জন্য দায়ী।

মেরিন, বায়ুমণ্ডলীয় এবং আর্থ সায়েন্সের রোজেনস্টিল স্কুলের বিজ্ঞানীদের কাছ থেকে একটি নতুন গবেষণায় আমাদের জলপথ এবং মহাসাগরে উপস্থিত বিভিন্ন ধরণের ভাইরাস উন্মোচন করতে সহায়তা করতে পারে। এই জ্ঞান স্থানীয় নেতাদের আরও ভালভাবে প্রস্তুত করতে সহায়তা করতে পারে যখন কোনও ক্ষতিকারক অ্যালগাল ব্লুম তাদের উপকূলরেখার উপর প্রভাব ফেলতে পারে বা অন্য কোনও ভাইরাস স্থানীয় উপসাগর, নদী বা হ্রদে উপস্থিত থাকে।

উচ্চ-পারফরম্যান্স কম্পিউটিং পদ্ধতিগুলি ব্যবহার করে গবেষকরা প্রকাশ্যে উপলভ্য সামুদ্রিক মেটাজেনমিক ডেটাসেটগুলিতে 230 উপন্যাস জায়ান্ট ভাইরাস চিহ্নিত করেছেন এবং তাদের কার্যকারিতা বৈশিষ্ট্যযুক্ত করেছেন।

জার্নালে প্রকাশিত প্রকৃতি এনপিজে ভাইরাস, তাদের অনুসন্ধানের মধ্যে রয়েছে সাহিত্যে পূর্বে অজানা নতুন দৈত্য ভাইরাস জিনোমগুলির আবিষ্কার। এই জিনোমগুলির মধ্যে, 530 নতুন কার্যকরী প্রোটিনগুলি আলোকসংশ্লেষণে জড়িত নয়টি প্রোটিন সহ বৈশিষ্ট্যযুক্ত ছিল। এটি ইঙ্গিত দেয় যে এই ভাইরাসগুলি সংক্রমণের সময় তাদের হোস্ট এবং সালোকসংশ্লেষণ প্রক্রিয়াটি পরিচালনা করতে সক্ষম হতে পারে।

“সমুদ্রের দৈত্য ভাইরাসগুলির বৈচিত্র্য এবং ভূমিকা এবং তারা কীভাবে শেত্তলাগুলি এবং অন্যান্য সমুদ্রের জীবাণুগুলির সাথে যোগাযোগ করে, আমরা সম্ভবত ক্ষতিকারক অ্যালগাল ব্লুমগুলি ভবিষ্যদ্বাণী করতে এবং পরিচালনা করতে পারি, যা ফ্লোরিডার পাশাপাশি সারা বিশ্বের মানব স্বাস্থ্যের ঝুঁকি,” মোহাম্মদ মনিরুজ্জামান বলেছেন, মোহাম্মদ মনিরুজ্জামান, এবং বিভাগের একজন সহকারী বিভাগের সহ-অনুমোদনকারী বলেছেন। “দৈত্য ভাইরাসগুলি প্রায়শই অনেক ফাইটোপ্ল্যাঙ্কটনের মৃত্যুর প্রধান কারণ হয়, যা খাদ্য ওয়েবকে সমর্থন করে সমুদ্রের বাস্তুসংস্থান এবং খাদ্য উত্সকে সমর্থন করে। দৈত্য ভাইরাসগুলিতে পাওয়া উপন্যাসের ফাংশনগুলির বায়োটনোলজিকাল সম্ভাবনা থাকতে পারে, কারণ এর মধ্যে কিছু ফাংশন উপন্যাসের এনজাইমগুলির প্রতিনিধিত্ব করতে পারে।”

সম্প্রতি অবধি, দৈত্য ভাইরাসগুলি বায়োইনফরম্যাটিক পাইপলাইনে সীমাবদ্ধতার কারণে বৈজ্ঞানিক পদ্ধতিগুলির দ্বারা মূলত সনাক্ত করা হয়েছিল। গবেষকরা নামে একটি উদ্ভাবনী সরঞ্জাম তৈরি করেছেন তাদের (আইওনফর্ম্যাটিক সরঞ্জাম জন্য ইউক্যারিওটিক ভাইরাস আরইকোভারি থেকে এনভায়রনমেন্টাল মেটেজএনওএমইএস), বিস্তৃত পাবলিক ডিএনএ সিকোয়েন্সিং ডেটাসেটের মধ্যে দৈত্য ভাইরাস জিনোমগুলি সনাক্ত করার জন্য ডিজাইন করা।

“আমরা আবিষ্কার করেছি যে দৈত্য ভাইরাসগুলি কার্বন বিপাক এবং সালোকসংশ্লেষণের মতো সেলুলার ফাংশনগুলির সাথে জড়িত জিনের অধিকারী – tradition তিহ্যগতভাবে কেবল সেলুলার জীবগুলিতেই পাওয়া যায়, বেনজামিন মিনচ, গবেষণার শীর্ষস্থানীয় লেখক এবং মেরিন বায়োলজি এবং ইকোলজি বিভাগের ডক্টরাল স্টুডেন্টের একজন ডক্টরাল শিক্ষার্থীকে রোজেনস্টেল স্কুলে মেটালির প্রস্তাব দেয়।” বায়োগোকেমিস্ট্রি। “

লেখকরা ফ্রস্ট ইনস্টিটিউট ফর ডেটা সায়েন্স অ্যান্ড কম্পিউটিং (আইডিএসসি) এর মিয়ামি বিশ্ববিদ্যালয়ের পেগাসাস সুপার কমপিউটারকে বৃহত্তর মেটাজেনোমগুলি প্রক্রিয়া ও একত্রিত করার জন্য ব্যবহার করেছিলেন – প্রায়শই লাইব্রেরির জন্য একটি গিগাবেস ছাড়িয়ে যায় – শত শত মাইক্রোবায়াল কমিউনিটি লাইব্রেরিগুলির পুনর্গঠন সক্ষম করে।

“এই গবেষণাটি আমাদের আমাদের জলপথে দূষণ এবং রোগজীবাণু নিরীক্ষণের ক্ষমতাতে সহায়তা করতে পারে এমন উপন্যাস ভাইরাস সনাক্তকরণের জন্য বিদ্যমান সরঞ্জামগুলি উন্নত করার জন্য একটি কাঠামো তৈরি করার অনুমতি দিয়েছে।” মিন যোগ।

গবেষণা দলটি মেরু থেকে পোল পর্যন্ত বিস্তৃত নয়টি বৃহত গ্লোবাল ওশান স্যাম্পলিং প্রকল্প থেকে ডিএনএ সিকোয়েন্সিং ডেটা ডাউনলোড করেছে। বেরেন ব্যবহার করে তারা ডেটা থেকে দৈত্য ভাইরাস জিনোমগুলি পুনরুদ্ধার করে। জিনোমগুলি এই ভাইরাসগুলি দ্বারা এনকোড করা ফাংশনগুলি চিহ্নিত করতে সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ জিন ফাংশন ডাটাবেসগুলি ব্যবহার করে টীকাযুক্ত করা হয়েছিল। এই জিনোমগুলি বর্তমানে সমস্ত উপলভ্য দৈত্য ভাইরাস প্রতিনিধিদের সাথে উপন্যাসের কার্যগুলি সনাক্ত করতে তুলনা করা হয়েছিল।

এই গবেষণার সুবিধার্থে ব্যবহৃত বেরেন প্রোগ্রামটি সিকোয়েন্সিং ডেটাসেটগুলিতে জায়ান্ট ভাইরাসগুলি সনাক্ত এবং শ্রেণিবদ্ধকরণের জন্য একটি সহজেই ব্যবহারযোগ্য, এক-স্টপ সরঞ্জাম সরবরাহ করে গবেষণা ক্ষেত্রে একটি ফাঁক পূরণ করে। বেরেন যে কারও ব্যবহারের জন্য উপলব্ধ এবং এখানে ডাউনলোড করা যেতে পারে:

“গ্লোবাল ওশান জায়ান্ট ভাইরাসগুলির জিনোমিক এবং কার্যকরী বৈচিত্র্যের সম্প্রসারণ” শীর্ষক সমীক্ষা জার্নালে 21 এপ্রিল, 2025 এ প্রকাশিত হয়েছিল প্রকৃতি এনপিজে ভাইরাস। লেখকরা হলেন বেনজামিন মিনচ এবং মিয়ামি রোজেনস্টিল স্কুল অফ মেরিন, বায়ুমণ্ডলীয় এবং আর্থ সায়েন্সের বিশ্ববিদ্যালয় থেকে মোহাম্মদ মনিরুজ্জামান।



Source link

Leave a Comment